"Rapid Detection of MicroRNA by a Silver Nanocluster DNA Probe". S. W. Yang, T. Vosch. ANALYTICAL CHEMISTRY 83, 6935 (2011). DOI: 10.1021/ac201903n
MicroRNAs (miRNAs) are regulatory small RNAs that have important roles
in numerous developmental, metabolic, and disease processes of plants
and animals. The individual levels of miRNAs can be useful biomarkers
for cellular events or disease diagnosis. Thus, innovative new tools for
rapid, specific, and sensitive detection of miRNAs are an important
field of research. Using the fluorescence properties of DNA-nanosilver
clusters (DNA/AgNC), we have designed a DNA/AgNC probe that can detect
the presence of target miRNA. Here, we show that the red fluorescence of
the DNA/AgNC probe is diminished upon the presence of target miRNA
without pre- or postmodification, addition of extra enhancer molecules,
and labeling. The DNA/AgNC probe emission was lowest when the
complementary miRNA target was present and was significantly higher for
four other control miRNA sequences. Also, when adding whole plant
endogenous RNA to the DNA/AgNC probe, the emission was significantly
higher for the mutant where miRNA was deficient. On the basis of these
findings, we suggest that these DNA/AgNC probes could be developed into a
new, simple, inexpensive, and instant technique for miRNAs detection.
Los microRNAs (miRNAs) son pequeños RNAs reguladores que desempeñan papeles importantes en numerosos procesos metabólicos, de desarrollo y de enfermedad en plantas y animales. Los niveles individuales de miRNAs pueden ser biomarcadores útiles para eventos celulares o para diagnóstico de enfermedades. Así, la innovación en las herramientas destinadas a la detección rápida, específica y sensible de miRNAs es un importante área de investigación. Usando las propiedades fluorescentes de los cúmulos de DNA-nanoplata (DNA/AgNC), se ha diseñado una sonda DNA/AgNC que puede detectar la presencia de miRNA objetivo. Aquí se muestra que la fluorescencia roja de la sonda DNA/AgNC disminuye ante la presencia del miRNA objetivo sin premodificación o sin postmodificación, la adición de moléculas aumentadoras extra, y el etiquetado. La emisión de la sonda DNA/AgNC fue mínima cuando el miRNA objetivo complementario estaba presente, y fue notablemente mayor para otras cuatro secuencias de mRNA de referencia. También, al agregar completamente el RNA endógeno de la planta a la sonda DNA/AgNC, la emisión resultó notablemente mayor para el mutante, en donde había deficiencia del miRNA. En base a estos resultados, se sugiere que estas sondas DNA/AgNC pudieran permitir el desarrollo de una nueva técnica sencilla, instantánea y económica y sencilla para la detección de miRNAs.
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